MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 2017 chromosome

Total Repeats: 3220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017374	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017374	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017374	TTC	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017374	GGT	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017374	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017374	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017374	TGG	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017374	GTG	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017374	ACC	2	6	4492	4497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017374	GGT	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017374	TGT	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017374	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017374	GTTT	2	8	4967	4974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017374	ATC	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017374	A	7	7	5163	5169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017374	A	6	6	5178	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017374	T	7	7	5206	5212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017374	T	15	15	5295	5309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017374	T	6	6	5340	5345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017374	GTTT	2	8	5350	5357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017374	GGT	2	6	5359	5364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017374	TAA	3	9	7179	7187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017374	ATAA	2	8	7572	7579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017374	TTA	2	6	7602	7607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017374	ATTATA	2	12	7666	7677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017374	ATT	2	6	7681	7686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017374	TTA	2	6	7707	7712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017374	CAA	2	6	7749	7754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017374	TATT	2	8	7771	7778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017374	A	6	6	7809	7814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017374	G	6	6	9547	9552	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017374	TGT	2	6	9563	9568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017374	G	6	6	9631	9636	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017374	AG	3	6	9649	9654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017374	AG	3	6	9709	9714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017374	T	6	6	9718	9723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017374	TGT	2	6	9731	9736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017374	ATTG	2	8	9778	9785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017374	TTTTG	2	10	9840	9849	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017374	AAG	2	6	9890	9895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017374	GCAA	2	8	9969	9976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017374	A	7	7	10055	10061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017374	TTG	2	6	10067	10072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017374	GC	3	6	10107	10112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017374	G	6	6	10167	10172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017374	TGCT	2	8	10173	10180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017374	TGG	3	9	10300	10308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017374	GAA	3	9	10317	10325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017374	TGG	2	6	10399	10404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017374	AGA	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017374	GGCC	2	8	10436	10443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017374	A	6	6	10472	10477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017374	AG	3	6	10535	10540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017374	AG	3	6	10545	10550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017374	TATT	2	8	10551	10558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017374	AGG	2	6	10647	10652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017374	T	6	6	11492	11497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017374	GCTTT	2	10	11505	11514	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017374	T	6	6	11512	11517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017374	ACC	2	6	11536	11541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017374	T	7	7	11574	11580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017374	TTAA	2	8	11603	11610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017374	A	6	6	14544	14549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017374	CA	3	6	14591	14596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017374	CTG	2	6	14612	14617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017374	C	6	6	16194	16199	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_017374	AAACAC	2	12	16235	16246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017374	AATC	2	8	20662	20669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017374	T	6	6	20730	20735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017374	GGT	2	6	20738	20743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017374	TGT	2	6	20770	20775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017374	TTA	2	6	20808	20813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017374	GGT	2	6	20858	20863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017374	TTTA	2	8	20927	20934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017374	A	6	6	20941	20946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017374	T	6	6	20959	20964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017374	A	6	6	20984	20989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017374	TTTG	2	8	20991	20998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017374	A	6	6	21003	21008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017374	A	6	6	21011	21016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017374	A	6	6	21090	21095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017374	A	6	6	21106	21111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017374	CTTTA	2	10	23223	23232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017374	GT	3	6	23271	23276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017374	TAAG	2	8	23280	23287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017374	A	18	18	23361	23378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017374	GTT	2	6	23440	23445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017374	A	6	6	23463	23468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017374	G	7	7	23469	23475	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017374	GTT	2	6	23486	23491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017374	TGT	2	6	23507	23512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017374	T	6	6	23521	23526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017374	A	6	6	23529	23534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017374	ATC	2	6	23774	23779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017374	AGCCT	2	10	23798	23807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017374	A	6	6	25139	25144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017374	A	7	7	25216	25222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017374	TA	3	6	25236	25241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017374	GAAT	2	8	26766	26773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017374	AAT	2	6	26792	26797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017374	A	7	7	26858	26864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017374	TTTTA	2	10	26909	26918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017374	TGGC	2	8	26988	26995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017374	T	7	7	27029	27035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017374	AG	3	6	27048	27053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017374	CTA	2	6	27100	27105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017374	T	6	6	27112	27117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017374	GC	3	6	27124	27129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017374	GGTT	2	8	29653	29660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017374	TAA	2	6	38303	38308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017374	A	6	6	38313	38318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017374	AG	3	6	38323	38328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017374	TAA	2	6	39768	39773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017374	ACC	2	6	42099	42104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017374	GCTT	2	8	42105	42112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017374	CTGT	2	8	42219	42226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017374	GAT	2	6	42233	42238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017374	TAG	2	6	42642	42647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017374	ACTTAG	2	12	42648	42659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017374	A	6	6	42700	42705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017374	T	6	6	48257	48262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017374	GATAA	2	10	48350	48359	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017374	T	6	6	48370	48375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017374	TAGC	2	8	48377	48384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017374	TTTA	2	8	57251	57258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017374	T	6	6	57322	57327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017374	GTG	2	6	57347	57352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017374	TAA	3	9	57457	57465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017374	AACGA	2	10	57502	57511	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017374	TTAAA	2	10	57514	57523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017374	ACAAA	2	10	57542	57551	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017374	A	6	6	57790	57795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017374	G	7	7	57796	57802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017374	TAA	2	6	57803	57808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017374	TGATA	2	10	57856	57865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017374	AGAAAA	2	12	58214	58225	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017374	ACTG	2	8	58247	58254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017374	A	7	7	58255	58261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017374	AAGCC	2	10	58316	58325	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017374	TAC	2	6	60417	60422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017374	CAA	2	6	60437	60442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017374	CTT	2	6	61205	61210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017374	AGG	2	6	62609	62614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017374	TGA	2	6	62665	62670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017374	AG	3	6	62701	62706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017374	ATT	2	6	62727	62732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017374	GGT	2	6	62736	62741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017374	AGA	2	6	62767	62772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017374	A	7	7	63966	63972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017374	A	7	7	63999	64005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017374	A	7	7	66803	66809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017374	A	6	6	66817	66822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017374	G	7	7	66823	66829	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017374	A	7	7	70289	70295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_017374	ATT	2	6	76754	76759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_017374	GGT	2	6	125700	125705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017374	AAAG	2	8	125851	125858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
298	NC_017374	AAAG	2	8	128579	128586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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